Территория заповедника входит в бассейн притока Днепра, р. Березины, и частично в бассейн р. Эссы, притока Уллы, впадающей в Западную Двину.
Заповедник расположен на Приморской низменности, в 10 км от моря, входит в Приморский климатический район с мягким климатом.
Основную часть территории заповедника составляет озеро и примыкающие к нему низинные и верховые болота.
Заповедник со всех сторон окружен сельскохозяйственными угодьями, площадь заповедника 3660 га, из них болота - 2603 га.
Вся Прибалтика и часть Беларуси расположена в зоне широколиственно-хвойных лесов, которая славится разнообразием своих ландшафтов. Большое влияние на природные особенности всего региона оказали оледенения и процессы , связанные с деятельностью послеледниковых водоемов. Также, немалое воздействие оказывает процесс поднятия дна Балтийского моря.
На сайте подробно рассмотрены особенности рельефа заповедников, флора и фауна заповедников, а так же их геологическое прошлое. Подробно рассмотрены древние экосистемы верховых болот и состояние морских побережий.
Прибалтийские заповедники находятся на стыке северного, южного и западного ареалов, а сочетание растительности свойственной для холодных бореальных хвойных лесов умеренного пояса и теплого атлантического времени, объясняет разнообразие флоры и фауны в заповедниках.
На сайте, показано, какое большое значение имеют Прибалтийские заповедники для гнездящихся на европейском Севере, пролетающих здесь водоплавающих птиц.
В Прибалтийском регионе расположены два старейших в Европе заповедника и один биосферный. Некоторые из Прибалтийских заповедников изучаются учеными уже более двух сотен лет!